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蛋白質(zhì)組研究:生命天書的新解碼?

前不久,《自然》雜志在線發(fā)表了中國科學家在早期肝細胞癌蛋白質(zhì)組研究領域取得的重大科研成果。這一研究測定了早期肝細胞癌的蛋白質(zhì)組表達譜和磷酸化蛋白質(zhì)組圖譜,發(fā)現(xiàn)了肝細胞癌精準治療的潛在新靶點——膽固醇酯化酶SOAT1。

90%以上的肝癌屬于肝細胞癌。對于普通人來說,這一研究最耀眼的成績,是給治療最兇險的一類肝細胞癌帶來了希望;對于蛋白質(zhì)組相關科研人員來說,這一成果是“中國人類蛋白質(zhì)組計劃迎來的第一道曙光”。

該成果論文的通訊作者、國家蛋白質(zhì)科學中心(北京)首席科學家賀福初院士認為:“這一成果證明,基因組學不能獨打天下,現(xiàn)在輪到蛋白質(zhì)組學上場了。”

回顧此前有關癌癥的研究成果,“基因”這個詞是在抗癌場景中出現(xiàn)的高頻詞——科學家相信:人類的某些基因隱藏著打開癌癥開關的鑰匙。這一思路符合學界對基因組學的一貫期待,賀福初院士介紹:“人們1985年開始醞釀基因組計劃的主要動力,就是希望能夠通過描繪和破解基因藍圖,揭示人類生老病死的規(guī)律和本質(zhì)。”

但人們將基因圖譜這本“天書”印出來后,發(fā)現(xiàn)解讀“天書”依舊是一大難題。

1994年澳大利亞科學家Marc Wikins首先提出蛋白質(zhì)組學這一概念。簡單來說,基因承載著人類的遺傳物質(zhì),而蛋白質(zhì)是遺傳物質(zhì)傳遞的最后一個環(huán)節(jié),是生命活動的執(zhí)行者,蛋白質(zhì)是組成人體所有細胞和組織的重要成分。一個生物系統(tǒng)在特定狀態(tài)下表達的所有種類的蛋白質(zhì)就是蛋白質(zhì)組。

1998年,“認為基因組學的發(fā)展或許遇到了瓶頸”的賀福初開始轉向蛋白質(zhì)組學研究。2002年,賀福初成為“國際人類蛋白質(zhì)組計劃”的重要參與者,并帶領中國科學家牽頭實施人類肝臟蛋白質(zhì)組計劃,他相信“基因組學解決不了的問題,或許蛋白質(zhì)組學能解決”。

目前賀福初團隊的研究思路與一些美國同行不同。據(jù)介紹,賀福初團隊的思路是用蛋白質(zhì)組學驅動的精準醫(yī)學“領跑”國際精準醫(yī)療;而美國的研究主流策略是“蛋白基因組學”,即將蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù)用于基因組的注釋,蛋白質(zhì)組的研究仍然需要“背靠”基因組、轉錄組。

科學家們對蛋白質(zhì)組學研究的價值存在爭議。賀福初說,學界更為主流的觀點是,蛋白質(zhì)組學的研究只是基因組學研究的“注解”。

而賀福初認為蛋白組研究不是基因組研究的“附庸”。以本次發(fā)表在《自然》雜志在線的研究為例,他希望更多人認同蛋白質(zhì)組研究的價值和作用。

賀福初團隊的這項研究持續(xù)了5年。研究發(fā)現(xiàn),在最兇險的一類肝細胞癌中,膽固醇穩(wěn)態(tài)失調(diào)與病發(fā)有直接聯(lián)系,具體來說,膽固醇酯化酶越活躍,這類患者的手術后復發(fā)或死亡風險越大。而如果膽固醇酯化酶SOAT1得到抑制,腫瘤的增殖和遷移能力也同時受到有效抑制。他們的研究還發(fā)現(xiàn),膽固醇酯化酶SOAT1在頭頸癌、胃癌、前列腺癌、腎癌和甲狀腺癌中均和患者較差的術后轉移和死亡表現(xiàn)正相關。

賀福初認為,這種基于蛋白質(zhì)組研究的“抗代謝失穩(wěn)”的抗癌思路,或可成為繼抗增殖抗癌療法和免疫抑制抗癌療法之后的抗癌新方向。

在前不久舉行的成果發(fā)布會上,施普林格 自然旗下自然科研大中華區(qū)總監(jiān)保羅 埃文斯在祝賀視頻中說:“《自然》雜志約有93%的拒稿率,因此這樣一篇論文發(fā)表出來是一項很大的成就,我深信這項研究工作將為蛋白質(zhì)組學所引導的精準醫(yī)學的發(fā)展作出有力貢獻。”

“蛋白組是解讀生命天書的利器。”該成果的第一作者、軍事科學院軍事醫(yī)學研究院研究員姜穎相信:“蛋白質(zhì)組學驅動的精準醫(yī)學時代正向我們走來。”

據(jù)悉,此前在“蛋白基因組學”研究模式的指導下,美國等國的科學家們已經(jīng)完成的精準醫(yī)療分子分型包括:結直腸癌、乳腺癌、卵巢癌和胃癌等。

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