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世界觀天下!輸入疾病信息即可生成靶點?AIGP大模型平臺發(fā)布


【資料圖】

“輸入病人疾病相關(guān)的多組學數(shù)據(jù),如胃癌病人,AIGP平臺即能夠分析其多組學數(shù)據(jù),找到針對這個胃癌病人的靶點,根據(jù)這個靶點生成一個抗體甚至一系列有多樣性的蛋白。最后,一鍵式生成的蛋白回到自動實驗室里合成蛋白。”3月23日,在百圖生科基于生命科學大模型驅(qū)動的AIGP平臺發(fā)布會上,百圖生科CTO 宋樂說。

宋樂在介紹AIGP平臺。 主辦方供圖。

宋樂介紹,上面所說的只是AIGP平臺其中一個功能,其還可以根據(jù)形狀及理化性質(zhì)(物理性質(zhì)和化學性質(zhì))需求,生成一系列滿足需求的蛋白。再就是根據(jù)一個蛋白質(zhì)靶點生成對應(yīng)和靶點結(jié)合的蛋白,比如針對新冠病毒生成一個蛋白,甚至針對石油相關(guān)的分子生成一個酶。

據(jù)了解,過去兩年多,百圖生科構(gòu)建了生命科學領(lǐng)域千億參數(shù)的跨模態(tài)大模型“xTrimo”。該大模型從跨物種、跨模態(tài)的生命信息中學習蛋白質(zhì)如何構(gòu)成和實現(xiàn)功能、如何相互作用、如何組合和調(diào)控細胞功能的關(guān)鍵規(guī)律,從而破解生命的自然語言 —— 蛋白質(zhì)。基于大模型,AI在一系列任務(wù)算法上取得了明顯進展,除了更好地完成結(jié)構(gòu)預(yù)測等基礎(chǔ)任務(wù)外,也開始可以根據(jù)不同的問題輸入,以生成的方式,設(shè)計創(chuàng)新的蛋白質(zhì),來回答各種生命科學問題。

目前,平臺設(shè)置了3類功能模塊,分別是Function to Protein Design(F2P,根據(jù)結(jié)構(gòu)、功能、可開發(fā)性等功能指標設(shè)計/優(yōu)化蛋白質(zhì))、Protein to Protein Design(P2P,給定抗原等目標蛋白,設(shè)計與之以特定方式結(jié)合的抗體等蛋白質(zhì)),以及Cell to Protein Design(C2P,給定細胞,發(fā)現(xiàn)調(diào)控細胞功能的靶點蛋白并設(shè)計相應(yīng)的調(diào)控蛋白)。

宋樂表示,此次平臺的發(fā)布,旨在將這一技術(shù)平臺的能力與更多行業(yè)人士分享,利用AI設(shè)計創(chuàng)新蛋白質(zhì)的能力,共同研發(fā)更多的前沿藥物和其他生命科學項目,也通過一系列挑戰(zhàn)性的新任務(wù),驅(qū)動AIGP平臺的技術(shù)進步。此前,AIGP平臺已經(jīng)進行了一段時間的內(nèi)部測試,在創(chuàng)新免疫調(diào)控藥物ImmuBot的研發(fā)中,貢獻了多個高性能彈頭、新功能傳感器的研發(fā)案例。

中國科學院院士、著名免疫學家董晨教授認為:“AI能夠解決的問題,就是對大數(shù)據(jù)的分析和進一步的演繹和應(yīng)用。在當下的時間節(jié)點,AIGP確實是一個呼之欲出的平臺。相信AIGP對于我們理解蛋白質(zhì),以及在生物系統(tǒng)中研究和發(fā)現(xiàn)它的功能和調(diào)控,乃至于將來研發(fā)新藥,都會有非常大的作用。”

百圖生科CEO劉維表示,雖然當前AI大模型和與之配套的大規(guī)模數(shù)據(jù)圖譜、高通量驗證體系都遠不完美,但已經(jīng)凝結(jié)了很多前沿技術(shù)的創(chuàng)新和探索,接下來,從開始展露一些能力到提高它的泛化能力和速度,需要更多專業(yè)人士的加入,以實現(xiàn)前沿項目的加速研發(fā)。

宋樂也表示,當前,根據(jù)不同模塊的輸入和要求,AIGP平臺可在較短時間內(nèi)設(shè)計和生成具有特定性質(zhì)的蛋白質(zhì)。今年6月起,部分功能模塊將進一步開放,讓專業(yè)用戶可以直接自主使用,在更多的研究場景調(diào)用AI的蛋白質(zhì)生成能力,激發(fā)更多的生命科學探索。

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